додому Internet en IT Hoe bio-informatica kunstmatige intelligentie gebruikt om genen te interpreteren en ziekterisico’s te...

Hoe bio-informatica kunstmatige intelligentie gebruikt om genen te interpreteren en ziekterisico’s te voorspellen

Je vergeet gemakkelijk dat er in elke cel miljarden chemische reacties plaatsvinden. Ze houden ons in leven. Ze houden ons op de been. Als deze processen mislukken, worden we ziek. The problem is that modern medicine produces data on a scale that the human brain cannot process. Wij zijn ons ervan bewust. Om het te begrijpen heb je een computer nodig. In het bijzonder zijn bio-informatica en kunstmatige intelligentie nodig om de kloof tussen ruwe biologische kennis en daadwerkelijke medische vooruitgang te overbruggen.

Overstroming van informatie in de moleculaire geneeskunde

Moleculair biologisch onderzoek gaat niet langer alleen over het mengen van chemicaliën in een bekerglas. Het draait allemaal om het creëren van grote datasets. Herinner je je het menselijk genoomproject nog? Dit is een enorme prestatie, maar het is nog maar het begin. Genoomsequencing heeft ons de letters van het leven gegeven, maar niet het verhaal.

Als de set klaar is, begint het eigenlijke werk. Researchers have to explain the connections between different data points. Zonder effectieve bio-informaticamethoden worden deze gegevens slechts nutteloze ruis. Zoals Hans-Werner Möwes van de Technische Universiteit van München opmerkt, zijn deze gegevens onbruikbaar zonder efficiënte rekenmethoden.

Biologen en programmeurs moeten hier samenwerken. Biologen weten wat genen betekenen. Programmeurs weten hoe ze netwerken moeten bouwen die informatie verzamelen en ordenen. Beiden kunnen niet meer alleen werken.

Op zoek naar BRCA-genen

Denk aan borstkanker. Het is belangrijk dat vrouwen met een familiegeschiedenis van deze aandoening hun genetische risico begrijpen. De meest bekende risicofactoren zijn mutaties van de BRCA1- en BRCA2-genen. Mutaties in een van deze verhogen het risico op borstkanker met 60-80%.

Het lijkt gemakkelijk om deze mutaties te identificeren. In werkelijkheid is dit een logistieke nachtmerrie. Menselijke biologen kunnen het menselijk genoom niet handmatig scannen en twee specifieke naaldsequenties vinden in een hooiberg van miljarden datapunten. Dit zal jaren duren. It is also easy to make mistakes.

Computers hebben de vergelijking veranderd. Een netwerk van slimme computers kan de volledige genetische code scannen in een fractie van de tijd die een mens nodig heeft om een ​​pagina te lezen. Ze melden afwijkingen. Hierdoor kunnen preventieve maatregelen in een vroeg stadium worden geïmplementeerd. Vroegtijdige detectie kan levens redden.

Find unknown causes using comparison

Deze technologie heeft toepassingen die verder gaan dan bekende genen zoals BRCA1 en BRCA2. Er zijn nog steeds veel ziekten die artsen niet kunnen verklaren. Deze worden vaak ‘zeldzame ziekten’ of eenvoudigweg onverklaarde ziekten genoemd.

Computationele analyse biedt een weg vooruit. Door de genomen te vergelijken van mensen die aan dezelfde onbekende ziekte lijden, kunnen algoritmen genetische overeenkomsten vinden. Als een bepaald genetisch patroon bij 90 procent van de patiënten voorkomt, maar niet bij gezonde controles, kan dat patroon de oorzaak zijn.

This approach shifts healthcare from reactive to proactive. De focus verschuift van het behandelen van de symptomen naar het oplossen van de oorzaak. Hierdoor kunnen onderzoekers potentiële therapeutische doelen identificeren die anders verborgen zouden blijven in de ruis van de genetische variatie van een individu.

Het snijvlak van biologie en code gaat over meer dan alleen snelheid. Het draait allemaal om de mogelijkheden. We openen deuren die voorheen gesloten bleven door enorme hoeveelheden data. Naarmate algoritmen slimmer worden, worden de vragen die we kunnen stellen over onze eigen biologie steeds groter. Gegevens wachten. Het gereedschap is klaar. De volgende stap is weten waar je op moet letten.

Buiten de norm: waarom kunstmatige intelligentie de regels van medische diagnose herschrijft

De tijd van het volledig vertrouwen op traditionele computeralgoritmen in de bio-informatica loopt ten einde. In plaats daarvan komen door kunstmatige intelligentie aangedreven systemen (vooral neurale netwerken) tussenbeide om complexe analytische taken uit te voeren. Dit zijn niet alleen snelle rekenmachines. Dit zijn tools die zijn getraind op grote datasets om autonome beslissingen en analyses te maken zonder constante menselijke tussenkomst.

Denk eens aan het trainingsproces van een borstkankerdetectiesysteem. De machine startte niet intuïtief. Het begint met gegevens. De radioloog maakt een reeks mammografieën waarop de tumor wordt gemarkeerd. Dit is basiswerk.

“We moeten de computer vertellen welke cellen in de afbeelding kankercellen zijn, zodat deze deze cellen kan leren en uiteindelijk individueel kan identificeren.”
— Shadi Albarkouni, Technische Universiteit van München

De logica is eenvoudig, maar effectief. Door het systeem deze gelabelde afbeeldingen te geven, leerden de onderzoekers het algoritme specifieke structurele patronen te herkennen die verband houden met kwaadaardige tumoren. Leer tumorweefsel van gezond weefsel te onderscheiden op basis van visuele aanwijzingen die moeilijk te detecteren zijn met het blote oog of door routineartsen.

Eenmaal getraind kan de AI zelf nieuwe mammogrambeelden scannen. Markeer en controleer verdachte constructies. Dit is geen sciencefiction. Sommige van deze systemen werken al op een niveau dat vergelijkbaar is met dat van menselijke radiologen. Deze toepassingen zijn niet beperkt tot borstkanker.

Huidkanker
Andere tumoren

Deze wijziging zal de workflow veranderen. Artsen hoeven voor elke scan niet langer uitsluitend te vertrouwen op handmatige patroonherkenning. Kunstmatige intelligentie neemt het zware werk van de eerste screening voor zijn rekening. Benadruk potentiële problemen. Een menselijke expert zal het vervolgens verifiëren.

Dit betekent niet dat u van arts moet wisselen. Dit verbetert hun capaciteiten. Deze technologie kan volume aan. Deskundigen zorgen voor de nuances. Voor patiënten betekent dit een snellere diagnose. Dit betekent minder fouten bij de diagnose. Dit betekent dat gezondheidszorgsystemen steeds geavanceerder worden.

De resultaten zijn al zichtbaar in de klinische praktijk. De nauwkeurigheid is vergelijkbaar met die van ervaren medische professionals. Dit is nog maar het begin. Hoe meer informatie aan het model wordt toegevoegd, hoe gedetailleerder de verschillen worden. De grens tussen menselijke en machineanalyse vervaagt, niet op een angstaanjagende manier, maar op een praktische manier.

We zijn op weg naar de toekomst van collaboratieve diagnostiek. De computer leverde het bewijs. Artsen zorgen voor achtergrondinformatie. Door samen te werken kunnen we betere resultaten behalen. Maar de waarde van technologie wordt bepaald door de informatie die het oplevert. Afval gaat erin, afval gaat eruit. Dit is nog steeds de basisregel.

Gamificatie in de Krebsforschung

Diagnose-algoritmen zijn nu zo goed als de gegevens die ze trainen. Das probleem? Medizinische experts hebben geen tijd gehad om een ​​​​webbeprobe handmatig op het etiket te plaatsen. Süleyman Albarqouni en zijn team zijn erkannt. Uw verlies is ongewild: een spel.

Het is absurd. Een computerspel voor Krebsbekämpfung?

Genau. Freiwillige Spieler navigeert door digitale Gewebeschnitte. Dit opvragen is simpel en brutaal: Identificeer de kunstzinnige Zellen. Schieße sie ab. Jede Klik op het trainingsdatapunt. De KI leert uit de scheiding van de mens. Als u weet dat de mens een goed idee heeft, kan de computer nog steeds geen verstand hebben. Dit is crowdsourcing in biologische massa. Er is een functie die werkt als je herkömmliche annotatie.

Die chaotische Welt der Proteinfaltung

Doch Krebs-diagnose is nu een Zweig. Der andere, misschien een beetje lichter, ligt in de bio-informatik. Hier is een eiwit.

Eiwitten zijn bedoeld voor het bereiden van kruiden. Een medicijn of een impfstof die u kunt gebruiken, kan veel beter werken, hoe deze machines ook werken. Een functie hangt 100% van uw vorm af. De 3D-structuur.

De structuur van het verhaal is een wiskundige nachtmerrie.

Neem een ​​eiwit met 150 aminozuren. De kans op fouten ligt bij $3^{150}$. Het is een Zahl, de menselijke verstand is ontstaan. Selbst für Supercomputer is een bruut forceermiddel. De mens kan geen enkele moeite doen. Man braucht een snelkoppeling. Man braucht intuïtie.

Hier kommt Künstliche Intelligenz ins Spiel. Nicht als Assistent, zoon als Erkunder.

AlphaFold en de Durchbruch

Google DeepMind heeft hier een Meilenstein-setzt. AlphaFold is geen populaire software. Er is een neuronale netwerk dat 170.000 eiwitsequenties en een aantal bestaande structuren heeft ontwikkeld.

Het proces is fascinerend. Die KI sucht nach Gesetzmäßigkeiten. Als u weet dat de aminozuren samenvoegen, zijn de lichamelijke condities erg stabiel en zijn de konformaties stabiel.

Als AlphaFold een volgende stap heeft gezet, is de passie van Magie.

Het ordenen van de volgorde is niet een van de meest voorkomende formulieren. Er worden plannen gemaakt voor een constructieve constructie op de gelerntenregels. Het is een van de dingen die de werkelijkheid vaak verblüffend nahekommt. Het is bedoeld om de Arzneimittelentwicklung van Jahren auf Tage te betreden. Of Stunden.

Die Grenzen zwischen Spiel, Biologie en datenverarbeitung verschwimmen. Ga algoritmen trainen door te klikken. Wir zwingen Maschinen, de Sprache der Proteine ​​zu sprechen. De code is van Skalpell.

Was het een probleem? We zijn wit.

Exit mobile version